중도퇴사자 연말정산 2026, 재취업·미취업별 방법과 놓친 공제 찾기

한눈에 보기 (2026년 10월 27일 기준)

회사를 그만두면 마지막 월급에서 세금이 정산되면서 "연말정산은 끝났다"고 생각하기 쉽습니다. 하지만 퇴사할 때 하는 정산은 본인 기본공제 정도만 넣은 약식이라, 실제로 받을 수 있는 공제보다 세금을 더 낸 상태인 경우가 많습니다.

이 글에서는 2026년에 퇴사한 사람을 기준으로 재취업 여부에 따라 무엇을 해야 하는지, 어떤 공제가 인정되고 어떤 공제가 빠지는지 정리했습니다.

퇴사할 때 회사가 하는 정산, 무엇이 빠지나

회사는 퇴사자의 마지막 급여를 줄 때 그해 받은 급여로 세금을 한 번 계산합니다. 이때는 회사가 알고 있는 정보만 들어갑니다.

보통 반영되는 것	보통 빠지는 것
본인 기본공제, 회사가 낸 4대보험료	신용카드 사용액, 의료비, 교육비
회사가 아는 부양가족 (입사 때 신고한 경우)	연금저축·IRP 납입액, 기부금, 월세

그래서 퇴사 후에 이 빠진 항목을 다시 넣어 정산하면 세금을 돌려받는 경우가 많습니다. 방법은 연말에 어디서 일하고 있느냐에 따라 나뉩니다.

상황	할 일	시기
올해 안에 재취업 (12월 31일 재직 중)	새 회사에 전 직장 근로소득 원천징수영수증 제출. 새 회사가 두 회사 소득을 합쳐 연말정산	2027년 1~2월 연말정산 때
올해 재취업 안 함	홈택스에서 종합소득세 신고. 간소화 자료를 불러와 빠진 공제 입력	2027년 5월
5월 신고도 놓침	경정청구로 더 낸 세금 돌려받기	법정신고기한부터 5년 이내

전 회사 인사·급여 담당자에게 요청: 가장 빠르고 확실합니다. 퇴사할 때 미리 받아두면 좋습니다.
홈택스 조회: 전 회사가 국세청에 지급명세서를 제출한 뒤에는 홈택스에서도 조회할 수 있습니다. 제출 시기에 따라 1월 연말정산 때 아직 안 보일 수 있습니다.

재취업했는데 전 직장 영수증을 안 내면: 새 회사는 자기 회사 급여만으로 정산하게 되고, 두 회사 소득이 합쳐지지 않아 나중에 세금을 더 내야 할 수 있습니다. 이 경우 5월에 직접 합산해서 종합소득세 신고를 해야 합니다.

중도퇴사자가 가장 많이 헷갈리는 부분입니다. 공제 항목에 따라 일한 기간에 쓴 돈만 인정되는 것과 1년 전체가 인정되는 것이 나뉩니다.

예를 들어 6월 말에 퇴사했다면 7~12월에 쓴 카드값과 병원비는 공제되지 않습니다. 반대로 12월에 연금저축에 넣은 돈이나 고향사랑기부는 퇴사 후에 했더라도 인정됩니다.

전 직장 원천징수영수증 받아두기: 재취업 여부와 관계없이 꼭 필요합니다.
얼마나 돌려받을지 가늠하기: 퇴사 때 이미 낸 세금(결정세액)이 거의 없다면 공제를 더 넣어도 돌려받을 돈이 없습니다. 원천징수영수증의 결정세액 칸을 먼저 확인하세요.
연금저축·기부는 연말까지 가능: 결정세액이 남아 있다면 12월 31일까지 넣은 연금저축과 기부금은 퇴사 후라도 공제됩니다.
재직 기간 영수증 챙기기: 간소화에 안 잡히는 안경, 교복, 월세 증빙은 일한 기간분만 모아두면 됩니다.

Q. 실업급여도 소득으로 합쳐서 신고해야 하나요?: 아닙니다. 실업급여(구직급여)는 비과세라 종합소득세 신고 대상이 아니고, 부양가족 소득 요건을 따질 때도 포함되지 않습니다.
Q. 퇴직금도 연말정산에 들어가나요?: 퇴직금은 퇴직소득으로 따로 세금을 떼고 끝나는 소득이라 연말정산이나 5월 종합소득세 신고에 합치지 않습니다.
Q. 퇴사 후 프리랜서로 일했어요.: 근로소득과 사업소득(3.3% 떼는 소득)을 합쳐 5월에 종합소득세를 신고해야 합니다. 이때 재직 기간 공제와 연금저축·기부금 공제를 함께 넣을 수 있습니다.
Q. 퇴사 후 아무것도 안 하면 손해인가요?: 신고를 안 해도 벌금은 없지만, 더 낸 세금을 그냥 두는 셈입니다. 5년 안에는 경정청구로 언제든 돌려받을 수 있으니, 금액이 크다면 꼭 챙기세요.

참고 자료 · 이 글은 2026년 10월 27일 기준으로 작성했습니다. 개인 상황에 따른 최종 판단은 국세청 국세상담센터(126)에서 확인하세요.
중도퇴사자 연말정산: 이직·미취업 시 정산 방법
KB Think, 퇴사자 연말정산은 언제 하나요
보아스매거진, 중도퇴사자 연말정산